Шпионкста агенция IMF е в немилост, след подозренията че е замесена в терористична атака над Кремъл. Итън Хънт (Том Круз) минава дълбоко в нелегалност в опит да изчисти опетненото име на агенцията, след обявяването на Протокол Фантом от президента на САЩ.